优缺点分析：三年师承：跟师时间短（三年），出师快；要求具有高中及以上学历。五年师承：跟师时间长（五年），需要两名推荐医师；要求具有高中及以上学历。2、指导老师不同三年师承：（一）具有中医类别中医或者民族医专业执业医师资格；（二）从事中医或者民族医临床工作15年以上，或者具有中医或者民族医副主任医师以上专业技术职务任职资格；（三）有丰富的临床经验和独特的技术专长；（四）遵纪守法，恪守职业道德，信誉良好；（五）在医疗机构中坚持临床实践，能够完成教学任务。
指导老师同时带教师承人员不得超过两名。五年师承：以师承方式学习中医的，其指导老师应当具有中医类别执业医师资格，从事中医临床工作十五年以上或者具有中医类副主任医师以上专业技术职务任职资格。指导老师同时带徒不超过四名。优缺点分析：三年师承：需要一位指导老师，指导老师3年可带教师承人员2名。五年师承：需要一位指导老师，指导老师5年可带教师承人员4名。
3、推荐医师不同:三年师承：无涉及五年师承：推荐医师应当为被推荐者长期临床实践所在省、自治区、直辖市相关专业中医类别执业医师。 优缺点分析：三年师承：不需要推荐医师。五年师承：需要推荐医师。4、考核方式不同三年师承：出师考核内容应当包括职业道德和业务水平，重点是传统医学专业基础知识与基本技能，学术经验、技术专长继承情况；方式包括综合笔试和临床实践技能考核。
五年师承：采用考核方式。考核实行专家评议方式，通过现场陈述问答、回顾性中医医术实践资料评议、中医药技术方法操作等形式对实践技能和效果进行科学量化考核。专家人数应当为不少于五人的奇数。考核专家应当对参加考核者使用中医药技术方法的安全性进行风险评估，并针对风险点考核其安全风险意识、相关知识及防范措施。根据参加考核者使用的中医药技术方法分为内服方药和外治技术两类进行考核。
优缺点分析：三年师承：考试方式为综合笔试 临床实践技能考核。五年师承：考试方式为现场考核，采用专家评议方式，是由专家对参加考核的人员现场提问的一种形式。专家人数应当为不少于五人的奇数。5、证书名称不同三年师承：考试通过后获取《传统医学师承出师证书》五年师承：考试通过后获取《中医（专长）医师资格证书》6、证书作用不同三年师承：取得《传统医学师承出师证书》后，在执业医师指导下，在授予《传统医学师承出师证书》或《传统医学医术确有专长证书》的省（自治区、直辖市）内的医疗机构中试用期满1年并考核合格，可以申请参加执业助理医师资格考试。
